孙文得知情况，果断下令召开同盟会高层会议，研究组建政府问题，以便尽快成立政府，免致夜长梦多，横生枝节。当时十四个省派往南京议事的代表，有十三个省的代表是同盟会员，因此，同盟会定了的事，也就等于通过了各省代表会议。
孙文命令一下，黄兴、陈其美等立刻行动，将在沪的同盟会首脑人物及骨干宋教仁、汪精卫、胡汉民、张继、张静江、马君武等全召集了起来，在孙文的行馆紧急讨论筹组政府事宜，一致同意举孙文为总统。但大家对于政府的组织形式却出现了意见分歧，宋教仁主张内阁制，以内阁总理对国会负责，将总统只作为象征性的国家元首。孙文很不高兴，说：“内阁制之意，乃使元首平日不当政治之冲，可现今为非常时期，内阁制断然难以实行！”
宋教仁却不让步，态度强硬，说：“只有内阁制，方可以保证民国的长治久安。国家元首至为神圣，不能有错，一切错误须由内阁承担，内阁不善，可以解散重组，随时更选，假如总统不良，则无术治之，因此，集权不如分权，内阁制是民国最好的组织形式。”
孙文大怒，说：“按你的内阁制，总统便是无用的赘疣，要此赘疣何用！我不做这个神圣的赘疣，以免误了革命的大计。”
胡汉民欲说服宋教仁，忙道：“非常时期，还是集权于总统一身为好，内阁制权力行使起来受牵制太多，实不宜在此北方未平、南方也形势混乱的时候实行。”
其他人也出言相劝，称非常时期宜于集权。
宋教仁理直气壮，说：“你等只看到眼前，却看不到将来，从长远看，只有内阁制才便于推行民主制度，防止集权过多而形成专制。”
黄兴见气氛紧张，忙对宋教仁耳语说：“遁初切莫做义气之争。”宋教仁大摇其头，表示非争不可。
孙文就冷笑说道：“对唯一信任的同志却要设置种种羁绊，我不知你意欲何为？”
胡汉民、汪精卫这时怒了起来，指斥宋教仁别有用心，说：“难道你宋教仁竟想做这个内阁总理吗？”
宋教仁说：“我不够资格，但黄兴黄克强却是总理的最好人选！”
孙文移动目光，对着黄兴。黄兴忙说：“我无意做总理，我也的确做不来内阁总理。”
宋教仁长叹，再无话说。
于是众人议决实行总统制，然后将分设各部的总长、次长等职衔一一议妥，最后决定请黄兴第二天亲赴南京，向各省代表中的同盟会员宣布组织决定。黄兴允诺。
众人正要散去，门外忽来传报：南京各省代表会议派王有兰、许冠尧为代表，前来欢迎孙先生归国，并说会议欲举孙先生为临时政府首脑，此来兼询孙先生的意见。众人大喜，孙文忙吩咐请二人进屋相见。
王、许两位进屋，向孙文致过问候后说：“各省会议代表闻听先生归国，无不雀跃喜慰，遂商量欲举先生为临时政府的大元帅，故派我俩先来征询先生意见。”
孙文挥手说：“大元帅不是政府首脑，要选就选总统，何用大元帅的名目！”
王、许说：“众人欲待袁世凯反正，迫清廷退位后，以总统名号酬其功劳，故预留总统之位以待袁公。”
孙文说：“只要袁世凯拥护共和，能致清廷退位，那时我自当辞职以让。”
王、许说：“好，我俩回去将先生此意告知众同仁。”
十二月二十八日，十四省代表会议开会，以十三票的绝对多数推选孙文为临时政府大总统。选举完毕，即通电全国，同时派汤尔和、王宠惠二人为代表，急赴上海迎孙文赴南京就任。孙文从上海乘专列直发南京，南京城内的绅商人民挤得人山人海一班，争欲一睹孙大总统的风采，“共和万岁”“孙大总统万岁”之声响彻天地。孙文脱帽作礼，向人群致意，然后被黄兴、徐绍桢等迎入原两江总督衙门改成的总统府。
一九一二年元月一日晚上十时，在总统府的大礼堂举行大总统就职仪式。孙文在休息室里对着镜子整衣正冠，问一旁侍候的朋友宋嘉树：“我…像个总统吗？”
宋嘉树神情激动，连声说：“像，像，像极了。”
此时胡汉民进来，催孙文说：“各省及陆海军的代表俱已到齐，请先生出席仪式。”
孙文点点头，在胡汉民的陪同下走进礼堂，礼堂内雷鸣般的掌声响了起来，孙文亦鼓掌应和，接着按定好的仪式由孙文宣誓。孙文站在台上，举起右手，左手持誓文，一字一句宣誓道：
“颠覆满清政府，巩固中华民国，图谋民生幸福，此国民的公意，文实遵之，以忠于国，为众服务，至专制政府既倒，国内无变乱，民国卓立于世界，为列帮公认，斯时文当解临时大总统之职，谨以此誓于国民。”
宣誓完毕，各省代表景耀月双手捧大总统印信上前，请孙文用印，孙文即在誓词上盖了印玺。接着孙文激昂陈言，宣告中华民国诞生，并以一九一二年为民国元年，宣言完毕，欢呼声与掌声骤起，鞭炮齐鸣。
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七一 风帆万里回（4）
孙文在欢呼声鞭炮声里走下台来，与鼓掌恭贺的各会议代表、政府组成人员握手，互贺中华民国成立，当握到黄兴的手时，黄兴语声哽咽，泪水纵横，孙文不由得也湿了眼眶，两个人的四只手握在一起，喜极而泣。黄兴说：“总理，民国今日成立了，你是民国的大总统了。”
孙文将黄兴的手紧紧攥住，说：“克强，我们终于盼到了这一天，但满清还未覆灭，尚需你继续助我。”
黄兴狠劲的点头。
孙文当选民国临时大总统的消息传到北京，袁世凯暴跳如雷，怒不可竭，舞手大骂道：“无耻的骗子，你们答应得好好的要推我做总统，如今却将孙文推上了台，我袁世凯是什么人，岂容你们如此捉弄！”
在袁世凯的授意下，北洋军各路人马的四十多位将领以段祺瑞、冯国璋、王士祯等领头，联名通电反对共和，宣称誓与南方民军血战到底。袁世凯又命退守直隶的山西巡抚张锡銮 带兵猛攻娘子关，命陕甘总督升允带兵出凉州以攻陕西乾州，同时发电斥责光复各省背信弃义，在国民大会未公决国体问题前成立民国政府，说和谈既然不能解决问题，那就兵戎相见！
孙文见袁世凯为总统之位而生恼怒，当即通电以告袁世凯，说：“文不忍南北战争，生灵涂炭，倘由君之力，不劳战争而达国民之宏远，保民族的调和，清室亦得安乐，此时文自当解职让位于公，区区此心，天日鉴之。”
袁世凯一生在阴谋诡计的漩涡里浮沉打转，如何能坦然便相信孙文的表白，他对孙文的通电理也不理，却使手段逼议和代表唐绍仪辞职，又宣布唐绍仪以前与南方代表谈妥的一切协定条款均属无效。
南方议和代表伍廷芳见袁世凯急恼下一味胡来，便通电责袁，说：“现民军已光复十余省，不能无一统一指挥之机关，在国民会议未议决之前，成立临时政府，选举临时大总统，此系光复各省内部组织之事，为政治之通例，若以此向诘，请问清政府为何在国民会议未议决国体之前不自行解散取消？唐绍仪为袁总理的全权谈判代表，有全权委托书为凭，不能因其现在的辞职而影响以前所议定的条款议案。”
袁世凯气呼呼的，对伍廷芳的责难不加理睬。
隆裕太后以及满清亲贵见北洋军各将领通电反对共和，拥护君主立宪，又见袁世凯对南方党人态度强硬，俱感大喜过望。良弼便撺缀隆裕命袁世凯对南方用兵。
隆裕是个没注意的人，就招了袁世凯进宫，说起对南方用兵的事，袁世凯极表赞成，但谈起军饷，袁世凯却苦着脸说：“国库已极度空虚，无银子可用，若大举兴兵，军饷却如何筹集呢？”
隆裕也想不来办法筹措军饷，只好不再提用兵的事，袁世凯暗笑而退。良弼知道了情由，忙入宫建议隆裕下诏，命各王公大臣毁家以抒国难，将历年累积的宦资拿了出来以充军饷。隆裕允准，忙下懿旨，要各亲贵王公拿钱出来。
懿旨一下，王公大臣们一齐皱起了眉头，暗骂良弼卑鄙，为立功竟献此害人之策，大家都肉痛自己的钱，无奈下勉勉强强凑了十万两银子，交到宫里。这点银子数量无疑太少，隆裕想了想，就从宫中将慈禧过去积存的私房钱、自己的体己钱都拿了出来，凑成白银五十万两，一并交给袁世凯。
袁世凯收了隆裕的银子，却嫌不够，就怂恿隆裕设法再筹。隆裕久处深宫，那里懂筹钱的事，苦恼不堪。袁世凯就帮她想办法，建议将宫中旧存的瓷器、书画等拿出来变卖，隆裕无法，点头照办，但宫中的瓷器、书画俱是极品，一般人哪能买得起，有钱的王公大臣又不敢这时候来买，因此一时竟找不到一个买主。
良弼见太后竟至为难到变卖宫中书画瓷器的地步，于是动员了载沣等人一同往见袁世凯，责之说：“五十万两银子，足可一战了，宫保为何迟迟不动，贻误战机？”
袁世凯说：“南北大战一起，岂是一战可以致胜的，势必连年累月的打下去，如今兵饷不足，我岂能轻启战端，必先粮饷丰足，我方立于不败之地，这才可以大举兴兵！”
载沣、良弼气得跺脚连连，袁世凯却傲然负手，对他们的其他言语再不理睬。
刚上任做了大总统的孙文见袁世凯中断南北议和，以兵威相临，也勃然大怒起来，便将两湖、江浙、山陕等省的可用之兵，编为六路北伐军，自任北伐总指挥，命各军一齐出击，或东向出兵，或北向强攻。
命令一下，军行参差，有奋力前攻的，有阳奉阴违的，还有拒不听令的，结果除第二路的淮扬军攻占了徐州外，其他五路根本一步未动。孙文气恼下又下令四川、云贵、两广，及福建江西等省派兵北上，但各省接令后以各种理由推脱，只广东省派姚雨平带了一万人马北上听令。孙文心中不喜，发电催促，各省却来电讨要兵饷，说无饷难以发兵。
临时政府刚刚成立，财政上没有一分钱的进帐，哪有银子可发兵饷。孙文无奈下便欲将汉冶萍煤铁公司抵押给日本人，以换取日元贷款，任临时政府实业总长的张骞却极力反对，联合了江苏都督程德全、浙江都督汤寿潜以及章太炎、赵风昌等人通电说：“日人谋我之心不死，今借日元而北伐满清，无异于饮鸩止渴，况且大冶之铁、萍乡之煤，为我第一大矿产，坐付他人，民国经济命脉置于人手，何以立国？”
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七一 风帆万里回（5）
孙文铁了心要尽快北伐，急于得款，就一面向张謇等解释说：“天寒而腹饥欲死，则典衣果腹，疗饥为先。”一面派人与在日本寓居的程宣怀联系，请他游说日人以成交贷款之事。但日本人要求的条件十分严酷，难以办成。孙文无奈只好另谋他法，但没有一个方法奏效。
没有钱发饷，前线的民军俱都按兵不动，姚雨平的粤军刚从广东开了过来，却斗志昂扬，请求立刻北伐。孙文便对秘书长胡汉民说：“临时政府由你和克强照料，我带姚雨平一军人马过江北伐！”
胡汉民大惊，急忙阻止，说：“孤军深入，取败之象，若此仗一败，即使重新和谈，我们也被动至极了。”
黄兴得讯也急忙往见孙文，极力相劝，孙文遂止北伐之念。
汪精卫与辞职后尚留在上海的唐绍仪见南北方骤然紧张起来，战争一触即发，深恐一经接战，和平再难得致，于是两人一面向袁世凯发电劝止，一面到南京见孙文斡旋，请求双方平息怒气，继续和谈。南方的军政要人多数不愿开战，孙文此刻也只能同意继续议和。袁世凯的兵戎相见本是假的，用来吓唬造势，因此汪、唐的斡旋很快见效，南北双方又宣布停战，和谈起来。
这时黄兴便建议孙文说：“和谈期间，不动刀兵，我们当修内政，稳定南方，以待时机，即使和谈破裂，那时南方根基已稳，人心依附，各派精诚团结，就大可北伐一讨满清了。”
孙文点头首肯，当下说湖北为首义之地，如今却无一人在临时政府内任职，湖北方面定有不服之意，应设法婉转解决此事。黄兴点头，想了想又说：“光复会也为一大组织，惜未有人入政府任职，此事也当解决。”
两人于是商议改政府的五部为十部，同时增设副总统与政府枢密顾问，以平衡各方关系。蔡元培也来南京建议说：“康梁为一大党，影响极广，可否在政府内为康有为设一位置，招其回国就职，以资号召？”
孙文摇头不允，叹息说：“我无睚眦之见，但如今革命已成不可阻挡之势，康有为却还在日本撰文诅咒革命，大倡保皇学说，招他恐引起人心不服，招致各同志的怨尤。”
原来武昌起义之后，南方各省纷纷独立，寓居日本的康有为痛心疾首，大骂革命不止，孙文回国做了总统之后，康有为更是大发脾气，骂道：“何物孙文，竟可以做大总统，足见革命党荒谬绝伦。”又说：“孙文之徒众，以革命为救国的良药，实不知革命乃是狂药，一人饮之，执刀而狂舞，大乐之下又分药与他人，他人饮之亦执刀狂舞，辗转相传，人人执刀，狂暴横行，先杀异己，然后自相残杀。其幸而遗存者，国破之后，也只可做亡国之奴隶矣。”
众弟子问：“如今局势如此，何策方可救国？”
康有为说：“看来只有‘虚君共和’一途了。”于是电令在上海的弟子徐佛苏、麦孟华向南北议和的代表进言，以虚君共和为国体。又派弟子盛先觉从日本回国，往上海、南京等处游说“虚君共和”的好处。
七二 乱世费思量（1）
元月二十四日，各省代表会议重新开会，选举黎元洪为副总统，同时通过了在政府内增设五部的提案，浙江都督汤寿潜被增选为交通总长；稍后孙文又致函聘章太炎为总统府枢密顾问。
汤寿潜得知自己被选为交通总长，遂请辞浙督之职，将赴南京上任，临走时推荐了三人，请浙江议会从三人之中推选一人为新任浙江都