同样的道理，中医将藏象系统通过经络直接从宇宙空间得来的能量名为“阳”，也称为先天之精，它化生阳气。而将从人体解剖系统（脾胃）转化而来的能量统称为“阴”，也称为后天之精，它化生阴气、阴血，《五常政大论》曰：“阴气内化，阳气外荣。”
第三、从人体与宇宙来划分。人的两个生理系统与宇宙空间都有密切的关系，但性质很不相同。解剖系统与大气以下的地球环境关系密切，这个环境提供了它所需要的一切，如水、空气及各种营养成分。因此中医里，地球环境为阴，“天为阳，地为阴”。
人体的藏象系统与地球之外的宇宙空间关系密切，它所需要的一切能量都最终来自遥远的星空，故而地球以外的空间环境为阳。因此藏象系统随地球的运行而运行，《生气通天论》曰：“故阳气者，一日而主外，平旦人气生，日中而阳气隆，日西而阳气已虚，气门乃闭。”
第四、从疾病的来源划分。请注意，中国的疾病理论不是站在解剖生理系统的角度，而是站在藏象生命系统的角度来论述。因此，有了阴病和阳病的区分。但不论是阴病还是阳病，指的都是藏象系统的疾病，而不是解剖系统疾病。如此划分，是为了标明疾病的两个来源。
源于解剖系统而最终影响到藏象系统的疾病称为阴病，例如，《太阴阳明论》曰：“食饮不节，起居不时者，阴受之。”意思是：饮食没有节制，起居黑白颠倒、房事过度，都会损害解剖生理系统的健康，最后影响到藏象生命体。《调经论》在讲到疾病时也说：“其生于阴者，得之饮食居处。”《灵枢·百病始生》曰：“喜怒不节则伤脏，脏伤则病起于阴。”
而由于藏象系统本身原因而引发的疾病称为阳病，因为藏象系统与宇宙空间风寒暑湿燥火热六气关系密切，它通过经络可以直接侵入藏象系统，故而阳病都来自身体以外，即是指我们地球以外的宇宙空间，故言“其生于阳者，得之风雨寒暑”。
《调经论》曰：“其生于阳者，得之风雨寒暑。”
《脉要精微论》曰：“故中恶风者，阳受之。”
《太阴阳明论》曰：“故犯贼风虚邪者，阳受之……阳受之则入六腑。”
第五、从藏象组织结构划分。《素问·金匮真言论》曰：“言人身之腑脏中阴阳，则脏者为阴，腑者为阳。肝心脾肺肾五脏皆为阴，胆胃大肠小肠膀胱三焦六腑皆为阳。”这里谈到的是藏象本身的组织划分，换言之，五藏之经络为阴，六腑之经络为阳。五藏受精于脾，脾化精于解剖系统的胃，胃得味于地球环境，故五藏为阴。六腑之经络对应天之六气，直接采气于宇宙空间，故六腑为阳。《太阴阳明论》曰：“故犯贼风虚邪者，阳受之……阳受之则入六腑。”
第六、从对人体生命的影响来划分。人体的两个生理系统对生命总体的影响不同，《阴阳应象大论》中有一句很有名的话：“阳生阴长，阳杀阴藏。”这里的“生杀”与“长藏”是两个完全不同的概念，它反映了两个生理系统对生命的不同作用。
“生”指生命的出现，这是世界上最为重要的事情之一，当一个生命诞生之初，生命的本质就决定了此生命无可替代的特性。“杀”（死）是指生命的终结，这也是世界上最为重要的事情之一，古语说“除死无大事”。“生死”都是生命最本质的两种变化。
“长”指生命的生长，它是生命发展的一种趋向。比如一个人出生以后，生长的情况可以各不相同，长得高一点，矮一点，脸上长几个麻点，甚至长得一条腿长一条腿短，都是可能发生的，也就是说它不是必然的，因此“长”并非生命的本质。“藏”意思就是存在，指一个生命存在的状态，比如说，虽然死亡是必然的，但何时死亡却是偶然的，心脏病突然发作未必一定意味着死亡，也许手边正好有救心丸，及时救下一命。因此“长藏”是生命存在与发展的两种状态，而且是非本质状态。
《内经》中将“生杀”归为阳的特性，即是说藏象系统是人体生命的本质，它控制生命两种质的变化。而“长藏”则是非本质的生命现象，它是解剖生理系统存在的状态。类似的观点还有许多，例如《阴阳离合论》曰：“天覆地载，万物方生……阳予之正，阴为之主。”这句话的意思是说：人独立于宇宙天地之中，阳是人的本质，故曰正；阴是人的生命现象，故曰主。后世医家对阳的本质作用也多有论述，如《类经附翼·求正录·大宝论》曰：“凡万物之生由乎阳，万物之死亦由乎阳，非阳能死物也，阳来则生，阳去则死”，“人是小乾坤，阳来则生，阳去则死”。
阳是人体生命的本质，这个观点并非中国所独有，印度《六问奥义书》也持此观点，它说：“惟太阳为生命，惟太阴为原质。凡此一切有形体者，皆原质也。故原质即形体。”这里说得更加清楚，太阳是生命的本质，而形体（太阴）则是生命的原质，这与《内经》“阳予之正，阴为之主”简直一模一样。
第七、从精神类型划分。人不但有两个生理系统，而且每个系统都有自己的精神中枢，我们将其称为两个精神主体。神魂魄意志对应五藏，喜怒忧思悲恐惊对应人类的大脑。中医对上述两类精神因素没有明确的阴阳划分，但人们在习惯上，隐隐约约将神魂魄意志划为阳，称为阳神，《灵枢·行针》曰：“重阳之人，其神易动。”而将喜怒忧思悲恐惊划为阴，将为阴神。
第八、从体内气来划分。藏象生命本身的能量系统可分为两种，即阴阳两气。为什么同样的能量会有不同的名称呢？因为它们来自两个不同的方向，有完全不同的作用。
凡由藏象经络直接从宇宙中吸取的能量称为阳气，凡是藏象系统通过人体解剖系统得到的能量则称为阴气，故阴气、阴血、津液都为阴的范围。但这样的划分只是为了好理解，实际的情况却要复杂得多，阴气和阳气还存在一种交换的机制。
我们上面所列举的阴阳划分只是大略，而不是中医阴阳的全部，只要我们能掌握住划分的两个核心，其它情况可以类推。
阴阳合和
我们说人体的两个生理系统各自独立，只是想说明二者存在的本质特点，但这并不意味着二者没有合作，相反合作是永恒的，否则生命就不会完美。两个系统的相互合作，有机统一，构成了阴阳的诸多关系。
在阴阳（两个生理系统）诸多关系中，平衡则是最高法则，任何一方的失衡都会影响对方的存在状态，最后导致疾病的产生。所以平衡就是健康，失衡即为疾病。中医里平衡有两个境界，平人平气与天人合一。
平人平气是阴阳平衡普通境界的标志。笔者上世纪七十年代有位太姥爷，是个江湖野郎中，但医术确实了得。小时候经常领他去别人家看病，每当患者给医资时，此老有句口头语“出家人不爱财，多多益善”，此话给我的印象很深刻，这也是社会上人们的普遍心态。其实中国的传统文化是反对“多多益善”的，而提倡平衡。孔子的儒家讲中庸其实就是平衡的另类说法，最后发展成了中国文化的核心。老子“以柔克刚”的思想，核心讲的还是平衡，它是达到平衡的一种手段和方法。
中医认为，平人平气则无病，任何多与少都可以造成疾病，多为太过，少为不及。例如阳气太过则身热，阴气太过则身寒。在藏象五行关系中，如果木太强，它会反克金，如果水太弱，则会被火所辱。这一思想贯穿了中医理论，《内经》中有许多记载，“谨察阴阳所在而调之，以平为期”、“平治于权衡”、“阳病治阴，阴病治阳，定其气血，各守其乡”。
中医认为，如果我们能一直做到平人平气，我们将可活到人之天年。《素问·上古天真论》曰：“其次有圣人者，处天地之和，从八风之理，适嗜欲于世俗之间，无恚嗔之心，行不欲离于世，被服章，举不欲观于俗，外不劳形于事，内无思想之患，以恬愉为务，以自得为功，形体不敝，精神不散，亦可以百数。”
天人合一是阴阳平衡的至高境界，《内经》中“形与神俱”、“形神合一”、“提挈天地，把握阴阳”，都是“天人合一”思想的延伸和具体应用。达到这一境界的人，将会发生生命的根本变化，此类人不但能活过天年以上，而且过了天年“神气”不散，即两个生理系统一直保持一致。中医里专门讲述了此类人不同凡响的生命奇迹。
《素问·上古天真论》曰：“余闻上古有真人者，提挈天地，把握阴阳，呼吸精气，独立守神，肌肉若一，故能寿敝天地，无有终时，此其道生。”关于真人，庄子曾在著作中用了大量篇幅来描述，例如“古之真人，不逆寡，不雄成，不谟士。若然者，过而弗悔，当而不自得也；若然者，登高不粟，入水不濡，入火不热……古之真人，其寝不梦，其觉无忧，其食不甘，其息深深……”这是多么辉煌的人生啊！我们相信这是真实的。
阴阳分离
尽管“天人合一”可以改变生命的法则，使人健康地活到天年以外。但无论多么长久，人总是要死的，宇宙中的星系也没有永远存在的道理。当死亡来临的时候，人体中的双子星座就解体了，阴阳分离了，“阴阳离决，精气乃绝”。
死亡一直是人们心头永远挥之不去的阴云，在生死两极中，其实人类对死亡的痛苦、恐惧，要远远大于对生的赞颂、感激。孔子曾无限感叹地总结说：“除死无大事！”这个世界上再没有比坟墓更能激发哲学家智慧的东西了，当面对着一片片坟茔的时候，那些具有超绝大智慧的人，只要低头沉思一会，就能感悟到宇宙、人生变化发展的真谛。假如这个世界上没有坟墓，恐怕我们直到今天也不会有任何形式的哲学。
为了扫去人们心头的这块阴云，不知有多少人苦苦求索。佛陀为了这个问题，曾度过了常人难以忍受的六年：每天以植物的果实和青草为食，有时甚至以动物的粪便度日。由于长时间的饥饿，他变得憔悴不堪，瘦骨嶙峋，座下的印痕只有骆驼蹄子一般大小，身上的发毛纷纷脱落，远远望去就像是一段枯木。
那么，什么是死亡呢？在人类的历史上，曾先后有过两个关于如何界定死亡的标准：
第一种是以呼吸、心脏停止工作作为死亡的标准。
在本世纪之前，人们常用停止呼吸来判定死亡。常识告诉人们，任何一个活着的人都有呼吸，都有脉搏，故有“人活一口气”之说。因而人们直观地将停止呼吸、没有心跳作为判断死亡的标准。但在执行这一标准的漫长历史当中，人们无数次地发现，在某一段时间里停止呼吸，没有了心跳，并不意味着死亡，有些人还可以再一次活过来，间隔的时间长短视情况而定，有的数小时，有的可长达数天。
1996年，一位57岁的瑜珈功爱好者、印度军官巴巴被埋入3米深的坑内，身体的四周都是填土。他在这样一个没有空气的地方足足待了三天，可是当他从坑中被挖出来时，身体健康，并向前来参观的上万名瑜珈迷挥手致意。
《搜神记》记载：晋朝咸宁年中，在琅琊这个地方，有一个人名叫颜畿，字世都。有一次他得病，恰好城中有个医生名叫张差，于是他就找张差看病。不知道什么缘故，竟然死在张差的家中。颜畿的家人前来迎丧，可是引魂的幡子却缠到树上，怎么也解不开。就在这天晚上，颜畿给家里人托梦说：我的寿命还没到，本来不应该死，可是这个庸医给我吃了太多的药，伤了我的五脏六腑。现在好了，我缓过来了，千万别把我给埋了。家人得到消息，急忙开棺验看，果然形骸如故，微有人色，而手爪所刮磨，棺板皆伤。渐有气，急以绵饮沥口，能咽，饮食稍多，能开目，不能言语。十余年，家人疲于供护，不复得操事。
为了避免假死发生，人类曾经想过许多办法，比如说，中国丧葬礼仪上的有些规定就与此有关，比如说停尸，一般人死后要停三天或者七天，有的要停七七四十九天。停尸的目的除了有利于组织丧事外，它最早的原因则是为了避免假死，通过停尸给生命一定的时间，从而避免假死被活埋的可能。
第二种是以大脑停止工作作为死亡的标准。
呼吸与心跳的停止不能作为死亡标准，人们自然想到了大脑。现代科学证明，大脑在人体生命过程中起着重要作用，当我们讨论人与动物的区别时，实际上在讨论人脑与动物脑的区别，人类的语言、思维、情感、善恶等，都与大脑的活动有关。
大脑的如此作用，使它可以作为生命的代表，因此人们用大脑的死亡来界定生命的去留，从形式上，当一个人的脑电波消失时，就可以判定其死亡。然而在实践过程中人们同样发现，这一死亡标准不够严密。大量的医案证实，当一个人大脑死亡时，并不能代表这个人其他部分生命的消失，此类病案在医学上称为“植物人”。
客观地说，上述两项人类死亡标准的设定都是不科学、不严密的。如果我们继续执行下去，那是相当不道德的。然而，人类社会的死亡现象随时随地都有发生，我们又不能没有死亡标准，否则会给法律、社会道德等的实施造成许多麻烦。
《黄帝内经》各篇在讨论阴阳关系时，许多都涉及什么是死亡的问题，例如《生气通天论》曰：“生之本，本于阴阳……此寿命之本也。”意思是生死的根本在于阴阳，《阴阳别论》进一步说：“别于阴者，知生死之期。”意思是了解了阴阳就了解了生命的本质，也就知道了生死的秘密。
按照中医两个生理系统的理论，人类生命的终结很可能存在第三个标准，即两个生理系统都死亡、崩溃、解体之后，才是真正的死亡来临，任何一个生理系统的消失，都不意味着生命的结束。
当藏象系统消失时，解剖生理系统很可能继续存在，“（人）百岁，神气皆�