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大科学家、量子力学发明人之一海森堡曾有一句名言：“我们所观察到的，并不是自然的本身，而是因我们提问方法所揭示的自然。”这是对目前认识方法的最有力的否定，因为科学发展到今天，所谓主观客观、唯心、唯物统统被打破，主观的、唯心的研究会越来越多，这才是世界的本质。美国物理学家惠勒曾说：“基本的量子现象只有当它被观察时才是一个现象。”这对那些死板的唯物主义，不啻当头一棒。
我们并非要彻底否定逻辑这种方法，只是想说明它很不完美，自身存在许多缺点，而建立在如此不完美方法之上的科学，也会存在许多先天不足，如果将科学视为唯一正确的方法，并用科学来界定其他方法，那是对人类的最大反动，是对人类的犯罪。
有人一看见批判现代科学就急，他们会伤心地说：没有了现代科学的方法，我们怎么去认识世界？其实天塌不下来，这个世界从来就没有什么救世主，一切都得靠我们自己。假如没有了现代科学，人类肯定会从另外的角度去认识世界。我们在此批判现代科学，正是想借此提倡另外一种方法，那就是源于东方的“天人合一”。
实际上，科学尽管有这样或那样的缺陷，但它仍然是目前我们认识世界的主要方法，它本身并没有什么错。错误的是我们，是我们对待科学的态度，那就是把科学奉为“唯一”。有些人冠冕堂皇地认为，这样是维护了科学的尊严，其实他是在败坏科学。更可耻地是，这样做完全是出于一种利益的需要，与维护科学精神没有一点关系。科学在这些人眼中，就像是街角站立的妓女，只要有需要，都可以拿来一用。
一种是政治的需要。政治与科学原本不搭界，历史上唯有宗教和政治关系密切。所以才会发生宗教战争，所以布鲁诺才会被宗教法庭判处死刑。然而，随着科学在历史中地位的突显，科学渐渐变成了一种新的迷信，并逐步向政治靠拢，或者说逐步被政治利用。因为利用科学的人发现，用科学来反对异己、维护统治真的妙不可言，他打了你一棒子，然后说：这与我无关，是棒子要打你，我也无能为力。当科学被政治利用的时候，科学的精神就荡然无存了。
一种是商业利润的需要。商业与科学关系紧密，就像是一对孪生兄弟，谁掌握了最新科学，谁就能创造丰厚的商业利润，所以这些年才杀出个比尔·盖茨。然而，商海中像比尔·盖茨式的人物必然是少数，绝大多数是想赚钱又没有新发明的人。可历来商人属于奸诈一类，他们很快发现，用科学去骗钱异常容易，只要在广告中加一些观众似懂非懂的科学名词，那钱就如同流水一般进了腰包。更有甚者，他们收买科学，一种新产品一出来，赶快拿钱找几个貌似有学问的人，开个鉴定会，写出一纸所谓鉴定意见，那产品就贴上了科学的标签，照骗不误。在这些人眼里，科学不是妓女是什么？
因此，我们呼唤对科学的正确态度，反对将科学当棒使、当刀砍的做法。世界是无限的，逻辑方法只是一种方法而已，在大千世界里肯定存在其他方法。“科学以外无世界”的看法，是井底的蛙鸣，应该说科学之外还是科学，攀登珠穆朗玛峰，从南坡可以上去，从北坡照样可以到达峰顶。将科学作为一种衡量的尺度，并以此来判定哪是真的、哪是假的，就如同穿了一件衣服，衣服太小，没有被衣服遮住的地方，难道就不是身体了吗？
如果我们不是上帝，不是神仙，那么世界上根本不存在唯一的方法。历史证明，刻意追求的“唯一”，都是别有用心的欺骗。请记住一个事实：人类的进步已经将无数当时所谓的“唯一真理”摆在了荒凉的古迹上，供好奇的后人瞻仰。玩弄历史的人，最后将被历史玩弄。
用这种态度来看待目前中医学与现代科学的冲突，我们就可以有一个明确的结论，中医是用另一类方法，是从另一类角度对生命的切入，我们不能因为它与现代科学有冲突，就彻底否定它的价值。
第2章 《易经》与《黄帝内经》里隐藏的生命未解之谜
人类文明中有许多未解之谜，比如埃及的金字塔、玛雅人的编年历；神话的同一性、早期文献的相似点……等等。这些未解之谜都有一个基本的倾向，那就是它们出现的时间比专家们估计的要早，而它们表现出来的文明程度，又都远远超越了现代科学的研究结论。
而在这诸多的未解之谜中，最现实的谜案就是中国的中医，它就好像是一具活的化石，在我们眼前晃来晃去。几千年过去了，我们触摸它、研究它，忍受着它无言的嘲弄，可就是不知其所以然。直到今天，《黄帝内经》与《易经》、《山海经》号称“三玄”，依然像天书一样不可通解。
第一节 那些古代医书都去哪了？
今本《黄帝内经》包括《素问》、《灵枢》两篇，各九九八十一卷，合一百六十二卷。两书侧重点各有不同，《素问》侧重于讲理论，如阴阳五行、病因、藏象、气血精液等，而《灵枢》则侧重于讲经络、针灸。
《黄帝内经》书名首见于《汉书·艺文志》，当时班固在写《汉书》时，将图书目录类统归于《艺文志》下。医药类书目又分为“医经”、“经方”、“房中”、“神仙”四小类，共记录医学文献868卷，其中“医经”类七家，共216卷，名目如下：
《黄帝内经》十八卷
《外经》三十七卷；
《扁鹊内经》九卷
《外经》十二卷；
《白氏内经》三十八卷
《外经》三十六卷；
《旁篇》二十五卷
从以上记载中可以看出，“内经”一名本不专指《黄帝内经》，但由于其它医书均已遗失，所以我们今天所说的《内经》就专指《黄帝内经》而言。
但《汉书》里没有说《黄帝内经》十八卷究竟包括哪些内容。到了晋朝，有一位大学者名皇甫谧在《甲乙经序》中说：“《黄帝内经》十八卷，今天有《针经》九卷，《素问》九卷，二九十八卷，即《内经》也。亦有所亡失。”文中的亡失是指《素问》的第七卷。现代人都认为，皇甫谧学术造诣很高，而且他生活的年代距汉代不远，故本其所言，将《内经》定为《素问》、《灵枢》两部分。
但也有学者不同意，认为《汉书》所载卷数18与今《内经》162篇对不上号，因为汉代没有积篇为卷的说法。据此，有人推论，当时《内经》的字数很少，大约只有今本的九分之一。其次，从内容分析，《素问》侧重理论，《灵枢》侧重经络针灸，两书用语、理论取舍均有不同之处，可证这是两部不相关的独立著作。
《汉书》其它子目下的著作也都与医学有关，“经方”包括方药、本草、内、外、妇、儿各科医书，总11家274卷；房中与神仙两类，也涉及医学内容，如房中类的“养阳方”、“有子方”，神仙类的按摩术、引导术等。
目前比较一致的看法是，《黄帝内经》与神话中的黄帝本无关联，冠以“黄帝”之名，是为了追本溯源。黄帝乃传说中的古帝王，曾有许多重大发明，使后人受益匪浅，故中华民族一直以黄帝为祖先，历代后人均以黄帝子孙为荣。古人由此将一切文物制度都归于黄帝名下，《淮南子·修务训》曾总结过这种归祖情结说：“世俗之人，多尊古而贱今，故为道者必托之于神农、黄帝而后能入说。”
《素问》之名，始见于张仲景《伤寒论序》：“感往昔之沧丧，伤横夭之莫救，乃勤求古训，博采众方，撰用《素问》、《九卷》、《八十一卷》、《阴阳大论》、《胎胪药录》，并《平脉辩证》，为《伤寒杂病论》合十六卷。”在我国正史中，《素问》之名见于《北齐书·马嗣明传》：“马嗣明，河内人，少明医术，博综经方，《甲乙》、《素问》、《明堂》、《本草》，莫不咸诵，为人诊候，一年前知其生死。”在目录学上，《素问》之名始见于《隋书·经籍志》：“黄帝素问九卷。”
《灵枢》作为书名，始见于唐代王冰为《素问》所作之注：“《灵枢经》曰，经脉为里，支而横者为络，络之别者为孙。”据学者们考证，最早时本无《灵枢》，仅有《九卷》，后改为《针经》，其后又改为《九灵》，到唐代时始称《灵枢》。有人认为，这种情况恰好说明一个问题，即古代民间相传的同一医书可能有许多不同版本，这样名称差异就较大，很可能内容多少也有区别。
关于《内经》的成书年代，历来有不同看法，归纳起来有以下几种：
1、成书于黄帝时期。因为《黄帝内经》是以设问形式写成的，主要是黄帝问臣下答，也有一些是臣下问黄帝答。所以有人直观地认为，《内经》就是黄帝写成的，因此其成书年代也与黄帝同期，如此推论，成书当在公元前3000年左右。但此观点现在很少有人坚持。
2、成书于战国时代。到了宋代，一批学者认为应该成书于战国时，始创此观点的有宋代邵雍，此人乃是研究《易经》的宗师，相传曾创“梅花易数”之法。他曾经说：“《素问》、《阴府》，七国之书也。”宋代大哲学家程颢也持此观点，他说：“《素问》书，出战国末，气象可见。若是三皇五帝典坟，文章自别，其气运处，绝浅近。”
3、成书于秦、汉之际。持此观点的学者众多，窦苹《酒谱》曰：“《内经》十八卷，言天地生育，人之寿夭系焉，信三坟之书也。然考其文章，知卒成是书者，六国秦汉之际也。”《四库全书简明目录》曰：“《黄帝素问》，原本残阙，王冰采《阴阳大论》以补之。其书云出于上古，固未必然。然亦必周秦间人，传述旧闻，著之竹帛，故贯通三才，包括万变。”
4、成书于汉代。从元朝开始，有人就怀疑此书成于汉代，元明之际的吕复曾说：“《内经》、《素问》，世称黄帝岐伯问答之书，乃观其旨意，殆非一时之言。其所撰述，亦非一人之手。刘向指为韩诸公子所著，程子谓出战国之末。而其大略，正如《礼记》之萃于汉儒，而与孔子、子思之言并传也。”此后，历朝各代均有人坚持汉代成书说，现代持此说者也不在少数。
综合这些观点，大约有两点是共同的：一是《内经》的成书时间与中医理论形成的时间是两回事；二是《黄帝内经》是一部集纳本，而绝非原著，是战国到汉代期间，许多人整理上古医书的结果，但在整理的过程中，有些医学家将自己对古医书的理解加进去，形成目前《内经》文风不统一的事实。
由于《内经》是集纳本，所以内容、编排上都有些混乱：
一是本身内容混乱，比如，《灵枢·本输篇》曰：“六府皆出足之三阳，上合于手者也。”但《经脉篇》中六府之大肠、小肠、三焦均属手经，非“出足之三阳”；《逆顺肥瘦篇》说“少阳之脉独下行”，可在《经脉篇》又说此脉为上行脉。
再比如说，《内经》中目前读不懂的地方有许多是观点不同，表现在“黄帝——雷公”对问，“黄帝——伯高”对问，“黄帝——少师”对问，“黄帝——少俞”对问，这些人在论述医理时并不相同，比如伯高与少俞都论及五味，伯高的“五味论”是按五行来安排的，而少俞的“五味论”却不按五行。
二是《素问》与《灵枢》之间有不对应的情况，例如《素问》里“虚里”、“缨脉”、“胞脉”、“溜脉”、“尻脉”、“解脉”、“大脉”、“散脉”等脉名特立独行，毫无统属，与《灵枢·经脉篇》的体系完全不同。
三是后人添加的东西与原本的内容混杂在一起，例如《灵枢·九宫八内》说，就源于汉代人对《易经》的理解，《乾凿度》中有一段关于太一游宫的记载，读起来云山雾罩：“易一阴一阳，合而为十五之谓道。阳变七之九，阴变八之六，亦合于十五，则彖变之数若一也。阳动而进，变七之九，象其气之息也；阴动而退，变八之六，象其气之消也。故太一取其数，以行九宫，四正四维皆合于十五。”此理论明显是后人对《易经》的发挥，而且发挥得十分牵强。
因此，中医的研究应该做这样一项工作：彻底分清楚《内经》的组成，将后人属于理解发挥的东西单列出来，尽量恢复古抄本的原貌。
既然《内经》是集纳本，也就是说在此以前应该有大量原始的医书存在，可这些医书又在哪里呢？
第二节 谁来证明中医的起源
搞不清楚来龙去脉的东西往往让人感到奇怪，比如说鬼魂。你在这个世界上找不到真实的鬼，如果哪个人见鬼了，那肯定会有大麻烦。孙悟空大家都感到很神奇，除了他的武功绝伦、事业崇高以外，恐怕也与他的出身有关——别人都有父有母，偏偏他没有，他是从石头里面蹦出来的。
中医学就是这样一种奇怪的东西。成系统的中医学——《黄帝内经》大约出现于春秋战国之际，春秋以前找不到任何中医学来历的线索，东汉以后又没有任何人有能力对它进行增补，在短短的200年左右的时间内，它一下就达到前所未有的高度，而且一经达到，后人就再也无法超越。这在逻辑上是无法成立的，因为一种医学想达到一定的程度，非经过漫长的时间酝酿不可，它就像是一坛好酒，时间越长越醇厚。而一种东西历史越长，留下的遗迹也就会越多。
中医没有关于起源的任何证据，这就是我们面临的问题。
但仔细想想，好像只能如此，因为中医的历史证据难以保留。比如说中药，它只是一些天然物质，有植物也有一些矿物，让这些东西保存下来很困难，即使在古墓中挖出一些这类东西，也很难确定